톰캣 서비스를 올릴 때 Resource is out of sync with the file system ~ 관련해서 에러가 나는 경우가 있습니다.

해당 오류는 svn 또는 cvs 싱크가 맞지 않아서 간혹 발생하는 오류라고 하네요.

진행중인 프로젝트를 새로고침하시면 해결이 된다고 합니다.

또는 

Project -> Clean... 를 하면 됩니다.